Soutenance d'HDR de Armel Salmon - Université De Rennes

Composition du jury:
Karine Alix, Professeur – AgroParisTech, France - Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon, Gif-sur-Yvette
Josep Casacuberta, CSIC Professor, Centre for Agricultural Genomics, Barcelona, Spain
Laurent Duret, Directeur de Recherche – CNRS, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 - UCB Lyon 1
Malika Ainouche, Professeur – Université de Rennes, UMR CNRS ECOBIO
Antoine Gravot, Professeur – Université de Rennes, UMR INRAE Institut Agro, UR, IGEPP

Mes recherches sont centrées sur les conséquences génomiques, évolutives et adaptatives et de la polyploïdie (duplication entière des génomes). Ce phénomène, fréquent chez les eucaryotes, et prépondérant chez les plantes, représente un mécanisme générateur de biodiversité via la formation de nouvelles espèces, de nouvelles combinaisons d’allèles, de nouvelles régulations de l’expression de réseaux de gènes dupliqués, et de nouvelles capacités adaptatives. On sait aujourd’hui que la duplication du génome a affecté de façon récurrente toutes les lignées d’Angiospermes qui dérivent toutes d’ancêtres polyploïdes et ont, selon les lignées, subi un nombre variable de duplications plus ou moins récentes, suivies de rediploïdisations (où une part du génome retourne temporairement à état diploïde) accompagnées de restructurations chromosomiques (principalement de fusions de chromosomes). Ces duplications affectent la dynamique du génome, la régulation (génétique ou épigénétique) de l’expression des gènes, engendrent des innovations phénotypiques, et retiennent de ce fait l’attention des biologistes tant dans les sciences de l’évolution, que dans les sciences environnementales ou agronomiques. Je m’intéresse plus particulièrement aux interactions structurales et fonctionnelles entre génomes homéologues (issus des progéniteurs des espèces allopolyploïdes néoformées) ou plus généralement entre gènes dupliqués, qui représentent une composante première dans l’étude de l’évolution et de la plasticité des génomes chez les plantes.