Soutenance de thèse - Flore Miomandre - Amphithéâtre - Bâtiment 15 - Campus Santé Villejean - Université De Rennes

Sous la direction de Reynald Gillet, François-Hugues Porée et Charlène Gadais

Face à l'urgence de l'antibiorésistance, ce projet de thèse vise à développer de nouveaux peptides antibactériens selon une stratégie ciblant un mécanisme alternatif et encore sous-exploité : la trans-traduction.
Ce processus de sauvetage des ribosomes bactériens bloqués lors de la synthèse protéique est essentiel à la survie des bactéries et spécifique aux procaryotes, ce qui en fait une cible idéale et sélective. Plus précisément, notre stratégie s'appuie sur la queue C-terminale de la protéine SmpB, actrice clé de la reconnaissance des ribosomes bloqués et de l’initiation du processus de sauvetage. En concevant des peptides mimes de cette queue, nous cherchons à bloquer la trans-traduction, proposant une alternative thérapeutique originale et potentiellement exempte de mécanismes résistances.
Ce travail démontre qu’un peptide composé des 29 derniers acides aminés de la queue C-ter de SmpB inhibe in vitro sélectivement et efficacement la trans-traduction chez E. coli. Son mode d’action par compétition avec la protéine native SmpB a été validé par cryo-EM. Ce candidat a été optimisé en développant une nouvelle séquence raccourcie à 24 résidus, et optimisée par des modifications de séquence et de structure secondaire. Une deuxième phase de modifications a permis l’identification d’un peptide de 17 acides aminés avec une perte limitée d’activité.

Composition du jury

• Céline Landon, Directrice de recherche, CNRS UPR 4301, CBM (Orléans)
• Eric Ennifar, Directeur de recherche CNRS, UMR CNRS 9002, IBMC (Strasbourg)
• Olga Iranzo, Directrice de recherche CNRS, UMR CNRS 7313, iSm2 (Marseille)
• Guillaume Compain, Maître de conférences, UMR 5248 CBMN, IECB (Bordeaux)
• Reynald Gillet, Professeur des universités, UMR CNRS 6290, ISCR (Rennes)
• François-Hugues Porée, Professeur des universités, UMR CNRS 6226, ISCR (Rennes)
• Charlène Gadais, Maîtresse de conférences, UMR CNRS 6226, ISCR (Rennes)